Если предусматривается деятельность, осуществление которой, согласно решению Государственной природоохранной службы, может существенно повлиять на охраняемую природную территорию европейского значения (Natura 2000), но которая не указана в Приложении 1 к Закону об оценке воздействия на окружающую среду и осуществление которой не подлежит оценке воздействия, ее влияние на охраняемую природную территорию европейского значения (Natura 2000) оценивается в соответствии с отдельно установленной процедурой, определенной Правилами Кабинета Министров № 300 от 19 апреля 2011 года «Порядок оценки воздействия на особо охраняемую природную территорию европейского значения (Natura 2000)».

Решение о применении оценки воздействия NATURA 2000 принимается ГСООС в процессе первоначальной оценки воздействия на окружающую среду, или НАООС может включить требование о проведении оценки воздействия на территорию NATURA 2000 в процесс ОВОС, в этом случае Программа ОВОС также должна включать требования к оценке воздействия NATURA 2000.

После принятия Решения о применении оценки воздействия на территорию «Натура 2000» необходимо запросить у НАООС условия, на которых будет проводиться оценка воздействия на территорию «Натура 2000».

В соответствии с настоящими условиями и требованиями Правил Кабинета министров № 300, оценка должна быть проведена, а результаты обобщены в Отчете.

В течение 60 дней после получения отчета инициатора проекта о воздействии на особо охраняемую природную территорию европейского значения (Natura 2000), НАООС должен вынести заключение по отчету.

Если предполагаемая деятельность является предметом заключения Европейской комиссии в соответствии с Законом об особо охраняемых природных территориях, заключение НАООС должно быть предоставлено в течение 45 дней с момента получения заключения Европейской комиссии.